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Enregistrement W2131310342 · doi:10.1158/0008-5472.can-04-4480

Reduced Expression of Hypoxia-Inducible Factor-1α in Perinecrotic Regions of Solid Tumors

2005· article· en· W2131310342 sur OpenAlexaff
Solmaz Sobhanifar, Christina Aquino‐Parsons, Eric J. Stanbridge, Peggy L. Olive

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypoxia (environmental)Tumor hypoxiaCancer researchBiologyHypoxia-inducible factorsTranscription factorGene expressionG alpha subunitHIF1APathologyInternal medicineMedicineChemistryGeneRadiation therapyProtein subunitAngiogenesisOxygenBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypoxia that develops in solid tumors stabilizes the hypoxia-inducible factor-1alpha (HIF-1alpha) subunit of the HIF-1 transcription factor, leading to up-regulation of dozens of hypoxia-regulated genes that increase glycolysis and oxygen delivery. HIF-1alpha and its downstream target gene CA9 have both been used as surrogate hypoxia markers, and, in general, high expression predicts for a poor response to treatment. Combinations of hypoxia markers offer the opportunity to measure changes in tumor oxygenation that may be relevant to tumor response to treatment. We compared the degree of colocalization of two endogenous markers for hypoxia, HIF-1alpha and carbonic anhydrase IX (CAIX), with a chemical marker for hypoxia, pimonidazole. Unexpectedly, expression of HIF-1alpha was reduced in the most hypoxic regions that border necrosis in xenograft tumors composed of SiHa cervical carcinoma, WiDr colon carcinoma, or M006 astrocytoma cells. Similar results were obtained for samples from three cervical cancer biopsies. However, CAIX was present in these perinecrotic cells that were also capable of metabolizing and binding a chemical marker for hypoxia, pimonidazole. In vitro experiments using tumor cells and tumor cubes incubated under anoxic conditions indicated that nutrient deprivation seems to be largely responsible for the lack of HIF-1alpha expression in perinecrotic regions. The half-life of CAIX was sufficiently long that, once formed, it remained for days in the absence of continued HIF-1alpha expression. These results have implications for the use of HIF-1alpha as an indicator of tumor hypoxia and aggressiveness as well as development of hypoxia-directed antitumor therapies based on the expression of HIF-1alpha.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations125
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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