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Enregistrement W2131311501 · doi:10.1534/g3.114.010769

Acquisition of a Leucine Zipper Motif as a Mechanism of Antimorphy for an Allele of the<i>Drosophila Hox</i>Gene<i>Sex Combs Reduced</i>

2014· article· en· W2131311501 sur OpenAlexafffund
Lovesha Sivanantharajah, Anthony Percival‐Smith

Notice bibliographique

RevueG3 Genes Genomes Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésLeucine zipperMutantBiologyDrosophila melanogasterGeneticsAlleleHox geneWild typeGeneHeptad repeatMolecular biologyCell biologyGene expressionPeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 1932, Müller first used the term "antimorphic" to describe mutant alleles that have an effect that is antagonistic to that of the wild-type allele from which they were derived. In a previous characterization of mutant alleles of the Drosophila melanogaster Hox gene, Sex combs reduced (Scr), we identified the missense, antimorphic allele Scr(14), which is a Ser10-to-Leu change in the N-terminally located, bilateran-specific octapeptide motif. Here we propose that the cause of Scr(14) antimorphy is the acquisition of a leucine zipper oligomerization motif spanning the octapeptide motif and adjacently located protostome-specific LASCY motif. Analysis of the primary and predicted secondary structures of the SCR N-terminus suggests that while the SCR(+) encodes a short, α-helical region containing one putative heptad repeat, the same region in SCR(14) encodes a longer, α-helical region containing two putative heptad repeats. In addition, in vitro cross-linking assays demonstrated strong oligomerization of SCR(14) but not SCR(+). For in vivo sex comb formation, we observed reciprocal inhibition of endogenous SCR(+) and SCR(14) activity by ectopic expression of truncated SCR(14) and SCR(+) peptides, respectively. The acquisition of an oligomerization domain in SCR(14) presents a novel mechanism of antimorphy relative to the dominant negative mechanism, which maintains oligomerization between the wild-type and mutant protein subunits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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