<i>Paenibacillus polymyxa</i>produces fusaricidin-type antifungal antibiotics active against<i>Leptosphaeria maculans</i>, the causative agent of blackleg disease of canola
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
A bacterial isolate capable of inhibiting the growth of Leptosphaeria maculans (Desmaz.) Ces. & De Not., the causative agent of blackleg disease of canola (Brassica napus L. and Brassica rapa L.), was identified as a potential biological control agent. This environmental isolate was determined to be Paenibacillus polymyxa based on its (i) biochemical and growth characteristics and (ii) 16S rRNA sequence similarity, and was given the strain designation PKB1. Antifungal peptides were produced by P. polymyxa PKB1 around the onset of sporulation, with optimal production on potato dextrose broth. The antifungal peptides were extracted from P. polymyxa PKB1 cells and (or) spores using methanol and were purified using size exclusion and reverse-phase chromatography. Characterization of the antifungal peptides was done using amino acid compositional analysis, Edman degradation sequencing from partially hydrolyzed material, and a variety of mass spectrometric methods. The purified antifungal material was found to be a mixture of related peptides of molecular masses 883, 897, 948, and 961 Da, with the most likely structure of the 897 Da component determined to be a cyclic depsipeptide with an unusual 15-guanidino-3-hydroxypentadecanoic acid moiety bound to a free amino group. These compounds are therefore members of the fusaricidin group of cyclic depsipeptides.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle