A Rifampin-Hypersensitive Mutant Reveals Differences between Strains of <i>Mycobacterium smegmatis</i> and Presence of a Novel Transposon, IS <i>1623</i>
Notice bibliographique
Résumé
Rifampin is a front-line antibiotic for the treatment of tuberculosis. Infections caused by rifampin- and multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains are difficult to treat and contribute to a poor clinical outcome. Rifampin resistance most often results from mutations in rpoB. However, some drug-resistant strains have rpoB alleles that encode the phenotype for susceptibility. Similarly, non-M. tuberculosis mycobacteria exhibit higher levels of baseline resistance to rifampin, despite the presence of rpoB alleles that encode the phenotype for susceptibility. To identify other genes involved in rifampin resistance, we generated a library of Mycobacterium smegmatis mc(2)155 transposon insertion mutants. Upon screening this library, we identified one mutant that was hypersensitive to rifampin. The transposon insertion was localized to the arr gene, which encodes rifampin ADP ribosyltransferase, an enzyme able to inactivate rifampin. Sequence analysis revealed differences in the arr alleles of M. smegmatis strain mc(2)155 and previously described strain DSM 43756. The arr region of strain mc(2)155 contains a second, partial copy of the arr gene plus a novel insertion sequence, IS1623.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».