Friend of GATA suppresses the GATA-induced transcription of hepcidin in hepatocytes through a GATA-regulatory element in the HAMP promoter
Notice bibliographique
Résumé
Hepcidin is an antimicrobial peptide hormone involved in the metabolism of iron, encoded for by the HAMP gene mainly in hepatocytes. It's expressed at lower levels in other cells such as the macrophages. The mechanisms that determine tissue-specific expression of hepcidin remain unclear. GATA- and its co-factor Friend of GATA (FOG) modulate the tissue-specific transcription of other genes involved in the metabolism of iron. GATA proteins are group of evolutionary conserved transcriptional regulators that bind to the consensus motif -WGATAR- in the promoter. We characterized a 1.3 kb fragment of the 5'-flanking sequence of the HAMP gene in Huh7 cells, which express HAMP. Transfection of 5'-deletions of the HAMP promoter in Huh7 cells revealed two regions, -932/-878 and -155/-96, that when deleted decreased promoter activity. Using site-directed mutations in the HAMP promoter region -155/-96 we identified two subregions, -138/-125 and -103/-98, which when mutated suppressed promoter activity by 70 and 90% respectively. Site -103/-98 with a sequence -TTATCT- to which endogenous GATA proteins 4 and 6 bind and transactivate HAMP is a GATA-regulatory element (RE). Mutation of the GATA-RE abrogated binding of GATA proteins 4 and 6 to the promoter and blunted the GATA transactivation of HAMP. FOG proteins 1 and 2 suppressed the endogenous and exogenous GATA activation of the HAMP promoter. We concluded that the GATA-RE, -TTATCT- in the HAMP promoter region -103/-98 is crucial for the GATA-4 and GATA-6 driven transcription of hepcidin in Huh7 cells and that FOG proteins moderate the transcription by suppressing the GATA transactivation of HAMP.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».