Products of trace methane oxidation during nonmethyltrophic growth by <i>Methanosarcina</i>
Notice bibliographique
Résumé
Our understanding of the metabolic pathways involved in the anaerobic oxidation of methane (AOM) is challenged by not having an isolated anaerobic methanotroph. Fortunately, trace methane oxidation (TMO) is carried out by isolated organisms closely related to anaerobic methanotrophs. As TMO likely shares metabolic similarities with the AOM metabolism, studies of TMO in culture experiments can serve to enhance our understanding of AOM. Here we explored TMO in cultures of Methanosarcina acetivorans grown separately on acetate and carbon monoxide. We observed no methane oxidation to carbon dioxide in the cultures grown on acetate, but did observe methane oxidation to acetate (1.1 × 10−6 ± 3.5 × 10−8 moles CH4 oxidized, 0.10% of the CH4 produced). Methane was exclusively converted to the methyl position. Because AOM lipids exhibit strong 13C depletion in nature, our results imply acetate does not play a major role as an AOM intermediate. The carbon monoxide cultures showed little or no methane conversion to carbon dioxide (1.9 × 10−7 ± 2.0 × 10−7 moles CH4 oxidized), moderate methane oxidation to acetate (1.8 × 10−7 ± 7.3 × 10−8 moles CH4 oxidized, 0.14% of biogenic CH4 production), and high methane conversion to the methyl groups of product methyl sulfides (4.0 × 10−6 ± 7.7 × 10−7 moles CH4 oxidized, 3.1% of biogenic CH4 production). Taken together, our results identify methyl sulfides as more likely intermediates in natural AOM than acetate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».