Paneth cell marker CD24 in NOD2 knockout organoids and in inflammatory bowel disease (IBD)
Notice bibliographique
Résumé
We read with great interest the article by Shanahan et al 1 describing the roles of environmental conditions, notably co-housing with wild type (WT) littermates, and mouse genetic background in nucleotide-binding oligomerisation domain-containing protein 2 (NOD2)-dependent production of anti-microbial peptides in the mouse intestine. These authors demonstrate that expression, translation and anti-microbial activity of α-defensins are independent of NOD2.1 Robertson et al 2 recently confirmed that housing conditions rather than NOD2 status influenced intestinal microbiota composition. Shanahan et al address the question whether an increase in the number of Paneth cells could compensate for a NOD2-dependent reduction in the level of defensin production in Paneth cells. Using a combination of hematoxylin and eosin staining (to assess crypt numbers), immunohistochemistry (using anti-lyzozyme staining) and flow cytometry (sorting for expression of lyzozyme and lack of expression of CD45—a haematopoietic cell marker) of the entire ilea of WT and NOD2-deficient mice showed NOD2 status did not influence Paneth cell numbers.1 CD24, a heavily glycosylated protein marker of intestinal crypt stem cells and Paneth cells, is upregulated in inflammatory bowel disease (IBD).3 ,4 Sato et al 3 demonstrated that the combination of CD24hi and …
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».