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Enregistrement W2131695984 · doi:10.1152/ajpcell.00157.2007

Interactions of transmembrane carbonic anhydrase, CAIX, with bicarbonate transporters

2007· article· en· W2131695984 sur OpenAlexaff
Patricio E. Morgan, Silvia Pastoreková, Alan K. Stuart-Tilley, Seth L. Alper, Joseph R. Casey

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme function and inhibition
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer Institute
Mots-clésCarbonic anhydraseBicarbonateTransmembrane proteinChemistryTransporterSecretionExtracellularBiochemistryCarbonic anhydrase IICell biologyTransport proteinTransmembrane domainCarbonic anhydrase inhibitorSodium–hydrogen antiporterBiophysicsEnzymeBiologyReceptorSodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Association of some plasma membrane bicarbonate transporters with carbonic anhydrase enzymes forms a bicarbonate transport metabolon to facilitate metabolic CO(2)-HCO(3)(-) conversions and coupled HCO(3)(-) transport. The transmembrane carbonic anhydrase, CAIX, with its extracellular catalytic site, is highly expressed in parietal and other cells of gastric mucosa, suggesting a role in acid secretion. We examined in transfected HEK293 cells the functional and physical interactions between CAIX and the parietal cell Cl(-)/HCO(3)(-) exchanger AE2 or the putative Cl(-)/HCO(3)(-) exchanger SLC26A7. Coexpression of CAIX increased AE2 transport activity by 28 +/- 7% and also activated transport mediated by AE1 and AE3 (32 +/- 10 and 37 +/- 9%, respectively). In contrast, despite a transport rate comparable to that of AE3, coexpressed CAIX did not alter transport associated with SLC26A7. The CAIX-associated increase of AE2 activity did not result from altered AE2 expression or cell surface processing. CAIX was coimmunoprecipitated with the coexpressed SLC4 polypeptides AE1, AE2, and AE3, but not with SLC26A7. GST pull-down assays with a series of domain-deleted forms of CAIX revealed that the catalytic domain of CAIX mediated interaction with AE2. AE2 and CAIX colocalized in human gastric mucosa, as indicated by coimmunofluorescence. This is the first example of a functional and physical interaction between a bicarbonate transporter and a transmembrane carbonic anhydrase. We conclude that CAIX can bind to some Cl(-)/HCO(3)(-) exchangers to form a bicarbonate transport metabolon.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations145
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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