Microsatellite analysis reveals genetically distinct populations of red pine (<i>Pinus resinosa</i>, Pinaceae)
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Notice bibliographique
Résumé
Red pine (Pinus resinosa Ait.) is an ecologically and economically important forest tree species of northeastern North America and is considered one of the most genetically depauperate conifer species in the region. We have isolated and characterized 13 nuclear microsatellite loci by screening a partial genomic library with di-, tri-, and tetranucleotide repeat oligonucleotide probes. In an analysis of over 500 individuals representing 17 red pine populations from Manitoba through Newfoundland, five polymorphic microsatellite loci with an average of nine alleles per locus were identified. The mean expected and observed heterozygosity values were 0.508 and 0.185, respectively. Significant departures from Hardy-Weinberg equilibrium with excess homozygosity indicating high levels of inbreeding were evident in all populations studied. The population differentiation was high with 28-35% of genetic variation partitioned among populations. The genetic distance analysis showed that three northeastern (two Newfoundland and one New Brunswick) populations are genetically distinct from the remaining populations. The coalescence-based analysis suggests that "northeastern" and "main" populations likely became isolated during the most recent Pleistocene glacial period, and severe population bottlenecks may have led to the evolution of a highly selfing mating system in red pine.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle