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Enregistrement W2131747785 · doi:10.1074/jbc.m300235200

A Novel Nontruncating APOB Gene Mutation, R463W, Causes Familial Hypobetalipoproteinemia

2003· article· en· W2131747785 sur OpenAlexaff
John R. Burnett, Jing Shan, Brooke A. Miskie, Amanda Whitfield, Jane Yuan, Khai Tran, C. James McKnight, Robert A. Hegele, Zemin Yao

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipid metabolism and disorders
Établissements canadiensRobarts Clinical TrialsUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApolipoprotein BMutantSecretionMutationInternal medicineEndocrinologyCompound heterozygosityRecombinant DNAMicrosomal triglyceride transfer proteinWild typeMutant proteinBiologyEndoplasmic reticulumHeterozygote advantageMolecular biologyGeneAlleleLipoproteinChemistryGeneticsMedicineCholesterolVery low-density lipoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Familial hypobetalipoproteinemia (FHBL), an autosomal co-dominant disorder, is associated with reduced plasma concentrations (<5th percentile for age and sex) of apolipoprotein (apo) B and beta-migrating lipoproteins. To date, only mutations in APOB encoding prematurely truncated apoB have been found in FHBL. We discovered a novel APOB gene mutation, namely R463W, in an extended Christian Lebanese FHBL kindred. Heterozygotes for R463W had the typical FHBL phenotype, whereas homozygotes had barely detectable apoB-100. The effect of the R463W mutation on apoB secretion was examined using transfected McA-RH7777 cells that expressed one of two recombinant human apoBs, namely B48 and B17. In both cases, the mutant proteins (B48RW and B17RW) were retained within the endoplasmic reticulum and were secreted poorly compared with their wild-type counterparts. Pulse-chase analysis showed that secretion efficiencies of B48RW and B17RW were, respectively, 45 and 40% lower than those of the wild-types. Substitution of Arg(463) with Ala in apoB-17 (B17RA) decreased secretion efficiency by approximately 50%, but substitution with Lys (B17RK) had no effect on secretion, indicating that the positive charge was important. Molecular modeling of apoB predicted that Arg(463) was in close proximity to Glu(756) and Asp(456). Substitution of Glu(756) with Gln (B17EQ) had no effect on secretion, but substitution of Asp(456) with Asn (B17DN) decreased secretion to the same extent as B17RW. In co-transfection experiments, the mutant B17RW showed increased binding to microsomal triglyceride transfer protein as compared with wild-type B17. Thus, the naturally occurring R463W mutant reveals a key local domain governing assembly and secretion of apoB-containing lipoproteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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