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Enregistrement W2131809876 · doi:10.1172/jci75199

Leiomodin-3 dysfunction results in thin filament disorganization and nemaline myopathy

2014· article· en· W2131809876 sur OpenAlexaff
Michaela Yuen, Sarah A. Sandaradura, James J. Dowling, Alla S. Kostyukova, Natalia Moroz, Kate Quinlan, Vilma‐Lotta Lehtokari, Gianina Ravenscroft, Emily J. Todd, Ozge Ceyhan‐Birsoy, David S. Gokhin, Jérôme Maluenda, Monkol Lek, Flora Nolent, Christopher T. Pappas, Stefanie M. Novak, Adele D’Amico, Edoardo Malfatti, Brett Thomas, Stacey Gabriel, Namrata Gupta, Mark J. Daly, Biljana Ilkovski, Peter J. Houweling, Ann E. Davidson, Lindsay C. Swanson, Catherine A. Brownstein, Vandana Gupta, Līvija Medne, Patrick Shannon, Nicole Martin, David Bick, Anders Flisberg, Eva Holmberg, Peter Van den Bergh, Pablo Lapunzina, Leigh B. Waddell, Darcée D. Sloboda, Enrico Bertini, David Chitayat, William R. Telfer, Annie Laquerrière, Carol C. Gregorio, Coen A. C. Ottenheijm, Carsten G. Bönnemann, Katarina Pelin, Alan H. Beggs, Yukiko Hayashi, Norma B. Romero, Nigel G. Laing, Ichizo Nishino, Carina Wallgren‐Pettersson, Judith Melki, Velia M. Fowler, Daniel G. MacArthur, Kathryn N. North, Nigel F. Clarke

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Institute on AgingNational Health and Medical Research CouncilNational Institutes of HealthFondation pour la Recherche MédicaleMinistero della SaluteMurdoch Children's Research InstituteUniversity of PennsylvaniaSchlumberger FoundationMuscular Dystrophy AssociationEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentBroad InstituteNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesMedical Research CouncilOspedale Pediatrico Bambino GesùChildren’s Hospital of Wisconsin Research InstituteGreat Ormond Street Hospital for Children
Mots-clésNemaline myopathyNebulinSkeletal muscleCongenital myopathyActinBiologySanger sequencingZebrafishMyopathyPhenotypeGeneGene knockdownCollagen VIMutationGeneticsMolecular biologyCell biologyMyocyteSarcomerePathologyMuscle biopsyAnatomyMedicineTitinBiopsy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nemaline myopathy (NM) is a genetic muscle disorder characterized by muscle dysfunction and electron-dense protein accumulations (nemaline bodies) in myofibers. Pathogenic mutations have been described in 9 genes to date, but the genetic basis remains unknown in many cases. Here, using an approach that combined whole-exome sequencing (WES) and Sanger sequencing, we identified homozygous or compound heterozygous variants in LMOD3 in 21 patients from 14 families with severe, usually lethal, NM. LMOD3 encodes leiomodin-3 (LMOD3), a 65-kDa protein expressed in skeletal and cardiac muscle. LMOD3 was expressed from early stages of muscle differentiation; localized to actin thin filaments, with enrichment near the pointed ends; and had strong actin filament-nucleating activity. Loss of LMOD3 in patient muscle resulted in shortening and disorganization of thin filaments. Knockdown of lmod3 in zebrafish replicated NM-associated functional and pathological phenotypes. Together, these findings indicate that mutations in the gene encoding LMOD3 underlie congenital myopathy and demonstrate that LMOD3 is essential for the organization of sarcomeric thin filaments in skeletal muscle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations204
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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