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Enregistrement W2131874464 · doi:10.1111/cla.12006

A phylogenetic analysis of the megadiverse <scp>C</scp>halcidoidea (<scp>H</scp>ymenoptera)

2013· article· en· W2131874464 sur OpenAlexaff
John M. Heraty, Roger A. Burks, Astrid Cruaud, Gary A. P. Gibson, Johan Liljeblad, James B. Munro, Jean–Yves Rasplus, Gérard Delvare, Petr Janšta, Alex Gumovsky, John Huber, James B. Woolley, Lars Krogmann, Steve Heydon, Andrew Polaszek, Stefan Schmidt, D C Darling, Michael W. Gates, Jason L. Mottern, Elizabeth A. Murray, Ana Dal Molin, Serguei V. Triapitsyn, Hannes Baur, John D. Pinto, Simon van Noort, Jeremiah George, Matthew Yoder

Notice bibliographique

RevueCladistics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHymenoptera taxonomy and phylogeny
Établissements canadiensRoyal Ontario MuseumUniversity of TorontoNatural Resources CanadaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesState Fund for Fundamental Research of UkraineBelgian Federal Science Policy OfficeAlexander von Humboldt-Stiftung
Mots-clésBiologyMonophylyPteromalidaeZoologyPhylogenetic treeEvolutionary biologyBotanyCladeParasitoidHymenopteraGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chalcidoidea (Hymenoptera) is extremely diverse with an estimated 500 000 species. We present the first phylogenetic analysis of the superfamily based on both morphological and molecular data. A web-based, systematics workbench mx was used to score 945 character states illustrated by 648 figures for 233 morphological characters for a total of 66 645 observations for 300 taxa. The matrix covers 22 chalcidoid families recognized herein and includes 268 genera within 78 of 83 subfamilies. Morphological data were analysed alone and in combination with molecular data from ribosomal 18S (2105 bp) and 28S D2-D5 expansion regions (1812 bp). Analyses were analysed alone and in combined datasets using implied-weights parsimony and likelihood. Proposed changes in higher classification resulting from the analyses include: (i) recognition of Eriaporidae, revised status; (ii) recognition of Cynipencyrtidae, revised status; (iii) recognition of Azotidae, revised status; (iv) inclusion of Sycophaginae in Agaonidae, revised status; (v) reclassification of Aphelinidae to include Aphelininae, Calesinae, Coccophaginae, Eretmocerinae and Eriaphytinae; (vi) inclusion of Cratominae and Panstenoninae within Pteromalinae (Pteromalidae), new synonymy; (vii) inclusion of Epichrysomallinae in Pteromalidae, revised status. At a higher level, Chalcidoidea was monophyletic, with Mymaridae the sister group of Rotoitidae plus the remaining Chalcidoidea. A eulophid lineage was recovered that included Aphelinidae, Azotidae, Eulophidae, Signiphoridae, Tetracampidae and Trichogrammatidae. Eucharitidae and Perilampidae were monophyletic if Eutrichosomatinae (Pteromalidae) was included, and Eupelmidae was monophyletic if Oodera (Pteromalidae: Cleonyminae) was included. Likelihood recovered a clade of Eupelmidae + (Tanaostigmatidae + (Cynipencyrtus + Encyrtidae). Support for other lineages and their impact on the classification of Chalcidoidea is discussed. Several life-history traits are mapped onto the new phylogeny.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations268
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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