MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2131888610 · doi:10.1111/jpy.12132

Resolving phenotypic plasticity and species designation in the morphologically challenging<i>Caulerpa racemosa</i>–<i>peltata</i>complex (Chlorophyta, Caulerpaceae)

2013· article· en· W2131888610 sur OpenAlexfundno aff
Gareth S. Belton, Willem F. Prud’homme van Reine, John M. Huisman, Stefano G. A. Draisma, Carlos Frederico D. Gurgel

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAustralian Research CouncilAustralian Biological Resources StudyNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyPhenotypic plasticityTaxonTaxonomy (biology)Species complexBotanySynonym (taxonomy)Phylogenetic treeEvolutionary biologyEcologyGenusGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although recent molecular studies have indicated the presence of a number of distinct species within the C aulerpa racemosa–peltata complex, due to the difficulties presented by high levels of phenotypic plasticity and the large number of synonyms, infra‐specific taxa, and names of uncertain affinity, taxonomic proposals are yet to be made. In this study, we aimed to resolve the taxonomy of the complex and provide an example of how historical nomenclature can best be integrated into molecular based taxonomies. We accomplished this by first determining the number of genetic species within our globally sampled data set through a combination of phylogenetic and species‐delimitation approaches of partial elongation factor TU and RUBISCO large subunit gene sequences. Guided by these results, comparative morphological examinations were then undertaken to gauge the extent of phenotypic plasticity within each species, as well as any morphological overlap between them. Our results revealed the presence of 11 distinct species within the complex, five of which showed high levels of phenotypic plasticity and partial overlap with other species. On the basis of observations of a large number of specimens, including type specimens/descriptions, and geographic inferences, we were able to confidently designate names for the lineages. Caulerpa peltata , C . imbricata and C . racemosa vars. laetevirens, occidentalis and turbinata were found to represent environmentally induced forms of a single species, for which the earlier‐described C . chemnitzia , previously regarded as a synonym of C . racemosa var. turbinata , is reinstated. C . cylindracea , C . lamourouxii, C . macrodisca , C . nummularia and C . oligophylla are also reinstated and two new species, C . macra stat. nov. and C . megadisca sp. nov., are proposed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations117
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of PhycologyMême sujetMarine and coastal plant biologyTravaux en français237 207