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Enregistrement W2131923477 · doi:10.1111/j.1537-2995.2005.04151.x

Collaborative study to evaluate a working reagent for West Nile virus RNA detection by nucleic acid testing

2004· article· en· W2131923477 sur OpenAlexaff
J. Saldanha, S. Shead, Alan Heath, Michael Drebot

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleic acid testTiterNatSerial dilutionWest Nile virusVialReagentVirologyNucleic acidChemistryChromatographyBiologyVirusMolecular biologyMedicineBiochemistryCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MathematicsPathologyInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A nucleic acid test (NAT) assay reference reagent for West Nile virus (WNV) RNA, consisting of heat-inactivated WNV grown in tissue culture and diluted in pooled, negative human plasma, was evaluated and quantitated in a collaborative study in which 14 laboratories participated. STUDY DESIGN AND METHODS: Participants were requested to assay serial half-log and log dilutions of the reagent to determine the RNA endpoint. A single endpoint for each such dilution series was calculated with the maximum likelihood method, which assumes that the probability of a positive result at a given dilution follows a Poisson distribution. The calculated endpoint was used to give an estimated "NAT-detectable units per mL" (not necessarily equivalent to genome equivalents/mL or copies/mL). The assays used by participants included qualitative and quantitative NAT assays and both the commercial WNV assays (Chiron and Roche). RESULTS: The estimated number of detectable units per mL for the 14 laboratories varied from log 2.0 to 3.0 with the exception of two outliers. The overall mean titer for all the assays was log 2.52 detectable units per mL (330 detectable units/mL). Multiple testing of individual vials by two laboratories indicated that there was no evidence of vial-to-vial variation in WNV content of the reference reagent. CONCLUSION: A reference reagent for WNV NAT assays has been established. The mean titer of the reagent, with the results from 14 laboratories, was 330 detectable units per mL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,133
Score d'incertitude au seuil0,661

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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