Collaborative study to evaluate a working reagent for West Nile virus RNA detection by nucleic acid testing
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: A nucleic acid test (NAT) assay reference reagent for West Nile virus (WNV) RNA, consisting of heat-inactivated WNV grown in tissue culture and diluted in pooled, negative human plasma, was evaluated and quantitated in a collaborative study in which 14 laboratories participated. STUDY DESIGN AND METHODS: Participants were requested to assay serial half-log and log dilutions of the reagent to determine the RNA endpoint. A single endpoint for each such dilution series was calculated with the maximum likelihood method, which assumes that the probability of a positive result at a given dilution follows a Poisson distribution. The calculated endpoint was used to give an estimated "NAT-detectable units per mL" (not necessarily equivalent to genome equivalents/mL or copies/mL). The assays used by participants included qualitative and quantitative NAT assays and both the commercial WNV assays (Chiron and Roche). RESULTS: The estimated number of detectable units per mL for the 14 laboratories varied from log 2.0 to 3.0 with the exception of two outliers. The overall mean titer for all the assays was log 2.52 detectable units per mL (330 detectable units/mL). Multiple testing of individual vials by two laboratories indicated that there was no evidence of vial-to-vial variation in WNV content of the reference reagent. CONCLUSION: A reference reagent for WNV NAT assays has been established. The mean titer of the reagent, with the results from 14 laboratories, was 330 detectable units per mL.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,117 | 0,090 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».