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Enregistrement W2132054520 · doi:10.1099/mic.0.025379-0

Characterization of the pathogenicity island protein PdpA and its role in the virulence of Francisella novicida

2009· article· en· W2132054520 sur OpenAlexafffund
Crystal L. Schmerk, Barry N. Duplantis, Diana Wang, Robert D. Burke, Alicia Y. Chou, Karen L. Elkins, Jagjit S. Ludu, Francis E. Nano

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacillus and Francisella bacterial research
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésFrancisellaFrancisella tularensisVirulenceTularemiaPathogenicity islandBiologyMicrobiologyMutantPathogenGeneVirologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Francisella tularensis is a highly virulent, intracellular pathogen that causes the disease tularaemia. A research surrogate for F. tularensis is Francisella novicida, which causes a tularaemia-like disease in mice, grows similarly in macrophages, and yet is unable to cause disease in humans. Both Francisella species contain a cluster of genes referred to as the Francisella pathogenicity island (FPI). Pathogenicity determinant protein A (PdpA), encoded by the pdpA gene, is located within the FPI and has been associated with the virulence of Francisella species. In this work we examined the properties of PdpA protein expression and localization as well as the phenotype of a F. novicida pdpA deletion mutant. Monoclonal antibody detection of PdpA showed that it is a soluble protein that is upregulated in iron-limiting conditions and undetectable in an mglA or mglB mutant background. Deletion of pdpA resulted in a strain that was highly attenuated for virulence in chicken embryos and mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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