Differential Display and Suppressive Subtractive Hybridization Used to Identify Granulosa Cell Messenger RNA Associated with Bovine Oocyte Developmental Competence1
Notice bibliographique
Résumé
The main objective of this study was to identify mRNA expressed in the granulosa cells characterizing differentiated follicles bearing developmentally competent bovine oocytes. Analytical comparisons were made on mRNA pools of granulosa cells using differential display reverse transcription polymerase chain reaction (DDRT) analysis and suppressive subtractive hybridization (SSH). With DDRT, mRNA patterns of granulosa cells from small (< 4 mm) and large (> 8 mm) follicles cultured in the presence or absence of LH were compared to identify mRNA associated with follicular size or with the LH response. Nine clones were sequenced, and two were identified. One of the clones, DRAK 1, was associated with the presence of LH in the medium. Other comparisons directed toward the identification of mRNA associated with the presence of a competent oocyte were done on granulosa cells collected in vivo from superstimulated heifers. With the DDRT analysis, four clones associated with the oocyte developmental competence status were identified. With the SSH analysis, four clones specific to the presence of an incompetent oocyte were sequenced and none were identified, whereas 49 clones specific to the presence of a competent oocyte were sequenced and 18 were identified. Among these clones, early growth response 1, sprouty 2, cytochrome C oxidase, matrix metalloproteinase inducer, matrix metalloproteinase, epiregulin, prostaglandin receptor, and progesterone receptor were the most relevant to the ovarian physiology being examined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».