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Enregistrement W2132114824 · doi:10.1095/biolreprod64.6.1812

Differential Display and Suppressive Subtractive Hybridization Used to Identify Granulosa Cell Messenger RNA Associated with Bovine Oocyte Developmental Competence1

2001· article· en· W2132114824 sur OpenAlexaff
Claude Robert, Dominic Gagné, D. Bousquet, Frank L. Barnes, Marc‐André Sirard

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensL'Alliance BoviteqUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySuppression subtractive hybridizationOocyteMessenger RNAIn situ hybridizationRNADifferential displayCell biologyGeneticsComputational biologyMolecular biologyEmbryoGenecDNA library

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The main objective of this study was to identify mRNA expressed in the granulosa cells characterizing differentiated follicles bearing developmentally competent bovine oocytes. Analytical comparisons were made on mRNA pools of granulosa cells using differential display reverse transcription polymerase chain reaction (DDRT) analysis and suppressive subtractive hybridization (SSH). With DDRT, mRNA patterns of granulosa cells from small (< 4 mm) and large (> 8 mm) follicles cultured in the presence or absence of LH were compared to identify mRNA associated with follicular size or with the LH response. Nine clones were sequenced, and two were identified. One of the clones, DRAK 1, was associated with the presence of LH in the medium. Other comparisons directed toward the identification of mRNA associated with the presence of a competent oocyte were done on granulosa cells collected in vivo from superstimulated heifers. With the DDRT analysis, four clones associated with the oocyte developmental competence status were identified. With the SSH analysis, four clones specific to the presence of an incompetent oocyte were sequenced and none were identified, whereas 49 clones specific to the presence of a competent oocyte were sequenced and 18 were identified. Among these clones, early growth response 1, sprouty 2, cytochrome C oxidase, matrix metalloproteinase inducer, matrix metalloproteinase, epiregulin, prostaglandin receptor, and progesterone receptor were the most relevant to the ovarian physiology being examined.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,385
Score d'incertitude au seuil0,613

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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