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Enregistrement W2132150144 · doi:10.1177/1753425912471691

Identification of a synthetic muramyl peptide derivative with enhanced Nod2 stimulatory capacity

2013· article· en· W2132150144 sur OpenAlexafffund
Stephen Rubino, João G. Magalhães, Dana J. Philpott, George M. Bahr, Didier Blanot, Stephen E. Girardin

Notice bibliographique

RevueInnate Immunity · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMuramyl dipeptideNOD2PeptidoglycanLipopolysaccharideChemistryLuciferaseInflammationIn vitroImmune systemBiologyImmunologyBiochemistryInnate immune systemTransfectionCell wall

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Muramyl peptides (MPs) represent the building blocks of bacterial peptidoglycan, a critical component of bacterial cell walls. MPs are well characterized for their immunomodulatory properties, and numerous studies have delineated the role of MPs or synthetic MP analogs in host defense, adjuvanticity and inflammation. More recently, Nod1 and Nod2 have been identified as the host sensors for specific MPs, and, in particular, Nod2 was shown to detect muramyl dipeptide (MDP), a MP found in both Gram-positive and Gram-negative bacterial cell walls. Because mutations in Nod2 are associated with the etiology of Crohn's disease, there is a need to identify synthetic MP analogs that could potentiate Nod2-dependent immunity. Here, we analyzed the Nod2-activating property of 36 MP analogs that had been tested previously for their adjuvanticity and anti-infectious activity. Using a luciferase-based screen, we demonstrate that addition of a methyl group to the second amino acid of MDP generates a MDP derivative with enhanced Nod2-activating capacity. We further validated these results in murine macrophages, human dendritic cells and in vivo. These results offer a basis for the rational development of synthetic MPs that could be used in the treatment of inflammatory disorders that have been associated with Nod2 dysfunction, such as Crohn's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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