The global regulator H‐NS binds to two distinct classes of sites within the Tn10 transpososome to promote transposition
Notice bibliographique
Résumé
The histone-like nucleoid structuring protein (H-NS) is a global transcriptional regulator that influences stress response and virulence pathways in Gram-negative bacteria. H-NS also promotes Tn10 transposition by binding directly to the transpososome and inducing a conformational change in the transpososome that favours intermolecular transposition events. H-NS binds preferentially to curved DNA and can bend non-curved DNA, it self-oligomerizes and can interact with other proteins. To determine what functions of H-NS are important in promoting Tn10 transposition, we have examined the ability of two mutant forms of H-NS, P116S and 1-64, to act in Tn10 transposition. We provide evidence that the initial interaction of H-NS with the transpososome is dependent on H-NS binding to a specific structure in DNA flanking the transposon end. Additional molecules of H-NS then bind within the transposon end. This latter event appears to be directed by H-NS binding to the Tn10 transposase protein, and is important in maintaining the transpososome in a conformation that promotes intermolecular transposition. The binding of H-NS to a transposase protein is a novel function for this important regulatory molecule.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».