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Enregistrement W2132170905 · doi:10.1128/aem.02178-10

Role of the Cell Wall Microenvironment in Expression of a Heterologous SpaP-S1 Fusion Protein by <i>Streptococcus gordonii</i>

2010· article· en· W2132170905 sur OpenAlexafffund
Elisabeth M. Davis, Dustin Kennedy, Scott A. Halperin, Song F. Lee

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésStreptococcus gordoniiHeterologousBiologyFusion proteinCell biologyCell fusionProtein expressionCellMicrobiologyStreptococcusBacteriaGeneticsRecombinant DNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The charge density in the cell wall microenvironment of Gram-positive bacteria is believed to influence the expression of heterologous proteins. To test this, the expression of a SpaP-S1 fusion protein, consisting of the surface protein SpaP of Streptococcus mutans and a pertussis toxin S1 fragment, was studied in the live vaccine candidate bacterium Streptococcus gordonii. Results showed that the parent strain PM14 expressed very low levels of SpaP-S1. By comparison, the dlt mutant strain, which has a mutation in the dlt operon preventing d-alanylation of the cell wall lipoteichoic acids, and another mutant strain, OB219(pPM14), which lacks the LPXTG major surface proteins SspA and SspB, expressed more SpaP-S1 than the parent. Both the dlt mutant and the OB219(pPM14) strain had a more negatively charged cell surface than PM14, suggesting that the negative charged cell wall played a role in the increase in SpaP-S1 production. Accordingly, the addition of Ca(2+), Mg(2+), and K(+), presumably increasing the positive charge of the cell wall, led to a reduction in SpaP-S1 production, while the addition of bicarbonate resulted in an increase in SpaP-S1 production. The level of SpaP-S1 production could be correlated with the level of PrsA, a peptidyl-prolyl cis/trans isomerase, in the cells. PrsA expression appears to be regulated by the cell envelope stress two-component regulatory system LiaSR. The results collectively indicate that the charge density of the cell wall microenvironment can modulate heterologous SpaP-S1 protein expression in S. gordonii and that this modulation is mediated by the level of PrsA, whose expression is regulated by the LiaSR two-component regulatory system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,001
Tête enseignante GPT0,137
Écart entre enseignants0,136 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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