Perturbation of transcription elongation influences the fidelity of internal exon inclusion in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Unknown mechanisms exist to ensure that exons are not skipped during biogenesis of mRNA. Studies have connected transcription elongation with regulated alternative exon inclusion. To determine whether the relative rates of transcription elongation and spliceosome assembly might play a general role in enforcing constitutive exon inclusion, we measured exon skipping for a natural two-intron gene in which the internal exon is constitutively included in the mRNA. Mutations in this gene that subtly reduce recognition of the intron 1 branchpoint cause exon skipping, indicating that rapid recognition of the first intron is important for enforcing exon inclusion. To test the role of transcription elongation, we treated cells to increase or decrease the rate of transcription elongation. Consistent with the "first come, first served" model, we found that exon skipping in vivo is inhibited when transcription is slowed by RNAP II mutants or when cells are treated with inhibitors of elongation. Expression of the elongation factor TFIIS stimulates exon skipping, and this effect is eliminated when lac repressor is targeted to DNA encoding the second intron. A mutation in U2 snRNA promotes exon skipping, presumably because a delay in recognition of the first intron allows elongating RNA polymerase to transcribe the downstream intron. This indicates that the relative rates of elongation and splicing are tuned so that the fidelity of exon inclusion is enhanced. These findings support a general role for kinetic coordination of transcription elongation and splicing during the transcription-dependent control of splicing.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle