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Enregistrement W2132231218 · doi:10.1002/qsar.200630005

Structural Requirements of Angiotensin I‐Converting Enzyme Inhibitory Peptides: Quantitative Structure‐Activity Relationship Modeling of Peptides Containing 4‐10 Amino Acid Residues

2006· article· en· W2132231218 sur OpenAlexaff
Rotimi E. Aluko, Shuryo Nakai

Notice bibliographique

RevueQSAR & Combinatorial Science · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Hydrolysis and Bioactive Peptides
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryTripeptideAmino acidTetrapeptideValineTryptophanBiochemistryIsoleucineLeucineMethionineExopeptidasePeptideQuantitative structure–activity relationshipCysteineTyrosineStereochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Models for angiotensin converting enzyme (ACE) inhibitory peptides with varied lengths are proposed based on results from partial least square regression analysis of the potency of known peptides. Modeling was performed using partial least square regression with inhibitory activity of peptides as the dependent variable (Y) and the physicochemical properties of amino acids as the predictor X matrix. Variable importance in the projection (VIP) analysis of individual amino acid residues at each position revealed that the C‐terminal tetrapeptide residues of long‐chain peptides were more important to their ACE‐inhibitory activity than the C‐terminal tripeptide residues. The most likely preferred amino acid residues starting from C‐terminus are tyrosine and cysteine for the first position, histidine, tryptophan and methionine for the second position with isoleucine, leucine, valine and methionine for the third position, and tryptophan for the fourth position. We concluded that the reported structural requirements of ACE‐inhibitory peptides provide useful information that can be used for the development of more efficacious ACE‐inhibitory peptides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations174
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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