Characterization of the Putative Type III Secretion ATPase CdsN (Cpn0707) of<i>Chlamydophila pneumoniae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Type III secretion (T3S) is utilized by a wide range of gram-negative bacterial pathogens to allow the efficient delivery of effector proteins into the host cell cytoplasm through the use of a syringe-like injectisome. Chlamydophila pneumoniae is a gram-negative, obligate intracellular pathogen that has the structural genes coding for a T3S system, but the functionality of the system has not yet been demonstrated. T3S is dependent on ATPase activity, which catalyzes the unfolding of proteins and the secretion of effector proteins through the injectisome. CdsN (Cpn0707) is predicted to be the T3S ATPase of C. pneumoniae based on sequence similarity to other T3S ATPases. Full-length CdsN and a C-terminal truncation of CdsN were cloned as glutathione S-transferase (GST)-tagged constructs and expressed in Escherichia coli. The GST-tagged C-terminal truncation of CdsN possessed ATPase activity, catalyzing the release of ADP and P(i) from ATP at a rate of 0.55 +/- 0.07 micromol min(-1) mg(-1) in a time- and dose-dependent manner. CdsN formed oligomers and high-molecular-weight multimers, as assessed by formaldehyde fixation and nondenaturing polyacrylamide gel electrophoresis. Using bacterial two-hybrid and GST pull-down assays, CdsN was shown to interact with CdsD, CdsL, CdsQ, and CopN, four putative structural components of the C. pneumoniae T3S system. CdsN also interacted with an unannotated protein, Cpn0706, a putative CdsN chaperone. Interactions between CdsN, CdsD, and CopN represent novel interactions not previously reported for other bacterial T3S systems and may be important in the localization and/or function of the ATPase at the inner membrane of C. pneumoniae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».