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Enregistrement W2132332231 · doi:10.1111/j.1550-7408.2005.00079.x

Identification of Three Distinct <i>Polytomella</i> Lineages Based on Mitochondrial DNA Features

2006· article· en· W2132332231 sur OpenAlexafffund
Martin A. Mallet, W. Robert Lee

Notice bibliographique

RevueJournal of Eukaryotic Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueAlgal biology and biofuel production
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDalhousie UniversityAbbott Laboratories
Mots-clésBiologyMitochondrial DNALineage (genetic)Chlamydomonas reinhardtiiPhylogenetic treeEvolutionary biologyGeneticsPhylogeneticsGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polytomella is composed of colorless green algae closely related to Chlamydomonas reinhardtii. Species in the genus have been used in diverse fields of biological research, most recently to study mitochondrial function and mitochondrial genome evolution in the Chlorophyceae, but the phylogenetic relationship between the various available taxa has not yet been clarified and it is not known whether they also possess fragmented mitochondrial genomes, as reported for Polytomella parva. We therefore examined cox1 sequence from seven Polytomella taxa with the goal of establishing their phylogenetic relationships and relating this information to their mitochondrial DNA (mtDNA) fragmentation pattern. We found that the Polytomella isolates examined fall into three distinct lineages, two of which possess fragmented mitochondrial genomes. The third and earliest branching lineage, represented by Polytomella capuana, appears to possess an intact mtDNA. In addition, there is evidence for variation in both size and number of mtDNA fragments between various Polytomella isolates, even within the same lineage. The considerable amount of sequence divergence between lineages seems to correlate with the geographic origin of the strains, leading us to believe that greater amounts of sequence divergence could be uncovered by a broader sampling of Polytomella.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,093
Score d'incertitude au seuil0,526

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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