Cancer testis antigens in newly diagnosed and relapse multiple myeloma: prognostic markers and potential targets for immunotherapy
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: In multiple myeloma, expression of cancer testis antigens may provide prognostic markers and potential targets for immunotherapy. Expression at relapse has not yet been evaluated for a large panel of cancer testis antigens which can be classified by varying expression in normal tissue: restricted to testis, expressed in testis and brain and not restricted but selectively expressed in testis. DESIGN AND METHODS: Evaluation of cancer testis antigen expression was made in newly diagnosed multiple myeloma cases (HOVON-65/GMMG-HD4 trial; n = 320) and in relapse cases (APEX, SUMMIT, CREST trials; n = 264). Presence of expression using Affymetrix GeneChips was determined for 123 cancer testis antigens. Of these 87 had a frequency of more than 5% in the newly diagnosed and relapsed patients, and were evaluated in detail. RESULTS: Tissue restriction was known for 58 out of 87 cancer testis antigens. A significantly lower frequency of presence calls in the relapsed compared to newly diagnosed cases was found for 3 out of 13 testis restricted genes, 2 out of 7 testis/brain restricted genes, and 17 out of 38 testis selective genes. MAGEC1, MAGEB2 and SSX1 were the most frequent testis-restricted cancer testis antigens in both data sets. Multivariate analysis demonstrated that presence of MAGEA6 and CDCA1 were clearly associated with shorter progression free survival, and presence of MAGEA9 with shorter overall survival in the set of newly diagnosed cases. In the set of relapse cases, presence of CTAG2 was associated with shorter progression free survival and presence of SSX1 with shorter overall survival. CONCLUSIONS: Relapsed multiple myeloma reveals extensive cancer testis antigen expression. Cancer testis antigens are confirmed as useful prognostic markers in newly diagnosed multiple myeloma patients and in relapsed multiple myeloma patients. The HOVON-65/GMMG-HD4 trial is registered under Dutch trial register n. NTR-213. CREST, SUMMIT and APEX trials were registered under ns. M34100-024, M34100-025 and NCT00049478/NCT00048230, respectively.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».