Dissociation of copper(ii) ternary complexes containing cystine
Notice bibliographique
Résumé
The collision-induced dissociations are reported for Cu(II) complexes containing 1,4,7-triazacyclononane (tacn) as the auxiliary ligand and a peptide containing one cystine residue. For six of the complexes examined, cleavage of the S-S bond in the peptide was the dominant fragmentation pathway. The exceptions were for complexes containing the largest peptides, (GlyCys'Gly)(2) and (GlyGlyCys')(2) (Cys' = NHCH(CH(2)S)CO, one half of the cystine residue; terminal H and OH are implicit), for which proton transfer to the auxiliary ligand was the major channel. Cleavage of the C-S bond was observed, but was a minor channel for all complexes. The radical cation (Cys')(2)(*+) was not observed although the complementary ion [Cu(I)(tacn)](+) was present in moderate abundance. Density functional calculations (at B3LYP/6-311++G(d,p)) gave low barriers to fragmentation of (Cys')(2)(*+) by homolytic fission of the C-S bond of the canonical ion (barrier 16.5 kcal mol(-1)) and of the structure at the global minimum, a captodative ion (barrier 17.2 kcal mol(-1)). Peptide radical cations (GlyCys')(2)(*+), (GlyCys'Gly)(2)(*+), (GlyGlyCys')(2)(*+) and (GlyCys'(Cys')Gly)(*+) were observed in low abundances; the first two of these ions dissociated predominantly by fragmentation of the S-S bond, while the other two preferentially cleaved at an amide bond. No cleavage of the C-S bond was observed for the peptide radical cations. Density functional calculations at B3LYP/6-31G(d) established that the cystine in [Cu(II)(tacn)(Cys')(2)](*2+) is bound as a zwitterion through the carboxylate anion with the proton on the distal amino group. The lowest energy complex containing a canonical cystine, coordinated through the carbonyl oxygen and the amino group of the same Cys', is 8.3 kcal mol(-1) higher in enthalpy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».