Candidate Genes in Patients with Autoinflammatory Syndrome Resembling Tumor Necrosis Factor Receptor-associated Periodic Syndrome Without Mutations in the <i>TNFRSF1A</i> Gene
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Tumor necrosis factor (TNF) receptor-associated periodic syndrome (TRAPS) is an autosomal-dominant multisystemic autoinflammatory condition. Patients display different mutations of the TNF receptor superfamily 1A gene (TNFRSF1A), coding for a nearly ubiquitous TNF receptor (TNFR1). No TNFRSF1A mutation has been identified in a proportion of patients with TRAPS-like phenotype. METHODS: We investigated mechanisms downregulating the TNF-induced inflammatory response such as (1) receptor shedding, producing a secreted form acting as a TNF inhibitor; (2) receptor internalization with subsequent induction of apoptosis; and (3) negative regulation of nuclear factor-κB (NF-κB) transcription. We analyzed the sequence of genes known to play a pivotal role in these pathways, in 5 patients with TRAPS symptoms and showing shedding and/or apoptosis defects, but without mutations of the TNFRSF1A gene. RESULTS: Sequence analysis of 3 genes involved in TNFR1 shedding (ERAP1, NUCB2, RBMX) and 3 genes involved in negative regulation of NF-κB signaling (TNFAIP3, CARP-2) or NF-κB transcription (ZFP36) revealed only a few unreported variants, apparently neutral. CONCLUSION: Our study rules out any involvement in the pathogenesis of TRAPS of some of the genes known to regulate TNFR1 shedding and TNF-induced NF-κB signaling and transcription. Gene(s) responsible for TRAPS-like syndrome remain to be investigated among currently unidentified genes likely involved in these pathways, or by applying the genome-wide function-free sequencing approach.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».