GENEALOGICAL DISCORDANCE AND PATTERNS OF INTROGRESSION AND SELECTION ACROSS A CRICKET HYBRID ZONE
Notice bibliographique
Résumé
In recently diverged species, ancestral polymorphism and introgression can cause incongruence between gene and species trees. In the face of hybridization, few genomic regions may exhibit reciprocal monophyly, and these regions, usually evolving rapidly under selection, may be important for the maintenance of species boundaries. In animals with internal fertilization, genes encoding seminal protein are candidate barrier genes. Recently diverged hybridizing species such as the field crickets Gryllus firmus and G. pennsylvanicus, offer excellent opportunities to investigate the origins of barriers to gene exchange. These recently diverged species form a well-characterized hybrid zone, and share ancestral polymorphisms across the genome. We analyzed DNA sequence divergence for seminal protein loci, housekeeping loci, and mtDNA, using a combination of analytical approaches and extensive sampling across both species and the hybrid zone. We report discordant genealogical patterns and differential introgression rates across the genome. The most dramatic outliers, showing near-zero introgression and more structured species trees, are also the only two seminal protein loci under selection. These are candidate barrier genes with possible reproductive functions. We also use genealogical data to examine the demographic history of the field crickets and the current structure of the hybrid zone.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».