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Enregistrement W2132608663 · doi:10.1002/hep.27004

Potential role of oxidative DNA damage in the impact of PNPLA3 variant (rs 738409 C>G) in hepatocellular carcinoma risk

2014· letter· en· W2132608663 sur OpenAlexaff
Emeric Limagne, Vanessa Cottet, Alexia K. Cotte, Samia Hamza, Patrick Hillon, Norbert Latruffe, Dominique Delmas

Notice bibliographique

RevueHepatology · 2014
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensEmergent BioSolutions (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatocellular carcinomaCirrhosisInternal medicineGastroenterologyOxidative stressSteatosisFibrosisMedicineNonalcoholic fatty liver diseaseAlcoholic liver diseaseHepatitis CFatty liverDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The meta-analysis by Trépo et al., recently published in this journal,1 demonstrated an association between PNPLA3 minor rs738409 [G] allele gene variant and hepatocellular carcinoma (HCC). This study follows a previous meta-analysis in nonalcoholic fatty liver disease patients showing increased steatosis, necroinflammatory, and fibrosis scores in rs73840 GG, compared to other patients.2 The mechanisms linking PNPLA3 GG variant to oxidative DNA damage markers are unknown. A carcinogenic role of oxidative stress (OS) has been demonstrated in viral hepatitis and alcoholic cirrhosis. The increased hepatic level of ubiquitous oxidative DNA damage markers, such as 8-hydroxy-deoxy-guanosine (8-OHdG), was positively correlated with fibrosis, inflammatory stages, and HCC risk in chronic hepatitis C patients.3 Moreover, linoleic acid peroxide plasmatic level (HODEs) is increased in HCC patients, leading to an overproduction of proangiogenic and -inflammatory factors, such as vascular endothelial growth factor and interleukin-8.4 Consequently, we hypothesized that OS could play a role in the mechanisms linking PNPLA3 GG variant and increased HCC risk. To evaluate OS according to PNPLA3 status, we randomized 86 patients with cirrhosis from the CiRCE case-control study: 43 with PNPLA3 rs738409 CC status and 43 with GG status matched for gender, age, severity of cirrhosis, presence of B or C viral infection, and time between cirrhosis diagnosis and inclusion in the study. HODEs and 7α- and 7-β-hydroxycholesterol plasmatic levels did not differ between GG and CC patients. On the other hand, 8-OHdG concentration was higher in GG (21.3 ± 4.1 ng/mL) than in CC patients (19.5 ± 2.2 ng/mL; P < 0.031; Table 1). This increase suggests a relationship between PNPLA3 GG status and oxidative DNA damage susceptible to explain over-risk of cancer in patients with cirrhosis. These results must be confirmed in larger population studies stratified according to cirrhosis etiology. Understanding carcinogenic mechanisms of GG status could lead to identifying new therapeutic targets in the prevention of chronic worsening liver disease and liver cancer. Emeric Limagne1,2 Vanessa Cottet, Ph.D.3,4 Alexia Karen Cotte1,2 Samia Hamza1,3,4 Patrick Hillon, M.D., Ph.D.1,3,4 Norbert Latruffe, Ph.D.1,2* Dominique Delmas, Ph.D.1,5* for the CiRCE Study Group 1Université de Bourgogne Dijon, France 2EA 7270 Bioperoxyl Dijon, France 3INSERM U866 Equipe Recherches épidémiologique et clinique en cancérologie digestive 4Service d'hépatogastroenterologie CHU Dijon Dijon, France 5INSERM U866 Equipe Chimiothérapie Métabolisme Lipidique et Réponse Immunitaire Antitumorale Dijon, France The CiRCE Study Group includes: (1) CiRCE Coordination France: J.P. Bronowicki, V. Di Martino, M. Doffoel, P. Hillon (CiRCE coordinator), and G. Thieffin; CiRCE Coordination China: H. Wen, F.P. He, and X.M. Lu and P. Hillon and D. Vuitton; (2) Circe Scientific Board: J. Faivre (President), J.P. Cercueil, V. Cottet, D. Delmas, P. Ducoroy, L. Duvillard, M. Guenneugues, J.L. Guéant, F. Habersetzer, N. Latruffe, M. Manfait, P. Oudet, and G. Sockalingum; (3) CiRCE pharmacologists: P. Trechot, M.B. Valnet-Rabier, T. Trenque, and M. Tebacher-Alt.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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