Genetic diversity of<i>Sinapis alba</i>germplasm as revealed by AFLP markers
Notice bibliographique
Résumé
Sinapis albaL. is a major specialty crop grown as a condiment in western Canada, but little is known about its genetic diversity. The objective of this study was to assess the level and pattern of genetic diversity in a collection of 127S. albaaccessions held at Plant Gene Resources of Canada using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Five AFLP primer pairs were applied, and 134 polymorphic bands were scored for each accession. These scored bands had frequencies of occurrence ranging from 0.02 to 0.99 with an average of 0.69. More AFLP variation was found within single (79.1%) than between (20.9%)S. albaaccessions. A small degree of AFLP difference (1.7%) was observed among the accessions of various regions, while relatively large variation (9.2%) existed among the accessions of various countries. A large AFLP difference (15.6%) also existed between the yellow- and brown-seeded accessions, but only 6.2% difference was observed between the cultivar and landrace accessions. Two distinct groups ofS. albagermplasm were identified on the basis of the seed colour (yellow or brown), although a few mixtures also existed. No apparent ‘duplicated’ accessions were observed. The most diverse accessions were from Italy, Spain, France and Greece. Among the most genetically distinct accessions were SA97 from Portugal, SA89 and SA88 from France, SA83 from Russia and SA57 from Italy. These findings are significant not only for managingS. albagermplasm, but also for identifying diverse germplasm that can be used by plant breeders to improveS. albaseed yield and quality parameters.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».