Small RNA-induced mRNA degradation achieved through both translation block and activated cleavage
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Small RNA (sRNA)-induced mRNA degradation occurs through binding of an sRNA to a target mRNA with the concomitant action of the RNA degradosome, which induces an endoribonuclease E (RNase E)-dependent cleavage and degradation of the targeted mRNA. Because many sRNAs bind at the ribosome-binding site (RBS), it is possible that the resulting translation block is sufficient to promote the rapid degradation of the targeted mRNA. Contrary to this mechanism, we report here that the pairing of the sRNA RyhB to the target mRNA sodB initiates mRNA degradation even in the absence of translation on the mRNA target. Remarkably, even though it pairs at the RBS, the sRNA RyhB induces mRNA cleavage in vivo at a distal site located >350 nucleotides (nt) downstream from the RBS, ruling out local cleavage near the pairing site. Both the RNA chaperone Hfq and the RNA degradosome are required for efficient cleavage at the distal site. Thus, beyond translation initiation block, sRNA-induced mRNA cleavage requires several unexpected steps, many of which are determined by structural features of the target mRNA.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle