Comparative field analyses of rapid analyte measurement platform and reverse transcriptase polymerase chain reaction assays for West Nile virus surveillance
Notice bibliographique
Résumé
Rapid detection of West Nile virus (WNV) in mosquito pools is essential for predicting epizootics and epidemics. We compare the efficiency and sensitivity of the Rapid Analyte Measurement Platform (RAMP) to reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) from 2005 to 2008 from field mosquito populations in Mercer County, NJ. Overall, 316 pools tested negative and 115 pools tested positive for WNV. Eighty-nine pools tested positive using RAMP and all were confirmed by RT-PCR; 26 pools were WNV-negative using RAMP but positive using RT-PCR. False-positives from RAMP were not detected in our four-year study, indicating that RAMP is a reliable tool when used to augment existing RT-PCR-based WNV surveillance programs. Local mosquito control programs using RAMP will benefit from its ease of use, quick results, and lack of false positives but should understand the sensitivity of this test when compared to RT-PCR. Used with standard methods, RAMP will enhance existing mosquito control and WNV surveillance by providing rapid results and improved mosquito management decisions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».