Identification of the acid phosphatase (acpA) gene homologues in pathogenic and non-pathogenic Burkholderia spp. facilitates TnphoA mutagenesis
Notice bibliographique
Résumé
Burkholderia pseudomallei and Burkholderia mallei are pathogens responsible for disease in both humans and animals. Burkholderia thailandensis, while phylogenetically similar, is considered avirulent in comparison. These three species exhibit phosphatase activity when grown on media containing chromogenic substrates such as 5-bromo-4-chloro-3-indolyl phosphate (XP). Tn5-OT182 mutagenesis has been utilized to isolate mutants of B. pseudomallei and B. thailandensis unable to hydrolyse XP. Sequence analysis of these mutants revealed an ORF of 1734 nucleotides demonstrating a high degree of homology to the acpA gene product of Francisella tularensis. PCR primers were designed based on the B. pseudomallei acpA gene sequence and were used to amplify an acpA homologue from B. mallei. The predicted amino acid sequence of B. pseudomallei AcpA differed from those of the predicted B. thailandensis AcpA and B. mallei AcpA by 15 and 3 amino acids, respectively. Allelic exchange was used to construct DeltaacpA mutants in each of these Burkholderia spp. These mutants were shown to be devoid of phosphatase activity and have subsequently allowed for the implementation of phoA fusion transposon mutagenesis systems. Two such systems have been successfully utilized in Burkholderia spp. for the identification of several genes encoding exported proteins.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».