Comparative proteomic analysis of NaCl stress-responsive proteins in Arabidopsis roots
Notice bibliographique
Résumé
NaCl stress is a major abiotic stress limiting the productivity and the geographical distribution of many plant species. Roots are the primary site of salinity perception. To understand better NaCl stress responses in Arabidopsis roots, a comparative proteomic analysis of roots that had been exposed to 150 mM NaCl for either 6 h or 48 h was conducted. Changes in the abundance of protein species within roots were examined using two-dimensional electrophoresis. Among the >1000 protein spots reproducibly detected on each gel, the abundance of 112 protein spots decreased and 103 increased, at one or both time points, in response to NaCl treatment. Through liquid-chromatography-tandem mass spectrometry, identity was assigned to 86 of the differentially abundant spots. The proteins identified included many previously characterized stress-responsive proteins and others related to processes including scavenging for reactive oxygen species; signal transduction; translation, cell wall biosynthesis, protein translation, processing and degradation; and metabolism of energy, amino acids, and hormones. At the resolution of individual genes and proteins, poor statistical correlation (6 h, r= -0.13; 48 h, r=0.11) of these protein expression data with previous microarray results was detected, supporting the concept that post-transcriptional regulation plays an important role in stress-responsive gene expression, and highlighting the need for combined transcriptomic and proteomic analyses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».