Modifier locus for exencephaly in<i>Cecr2</i>mutant mice is syntenic to the 10q25.3 region associated with neural tube defects in humans
Notice bibliographique
Résumé
Neural tube defects (NTDs), the second most common birth defect in humans, are multifactorial with complex genetic and environmental causes, although the genetic factors are almost completely unknown. In mice, >100 single gene mutations cause NTDs; however, the penetrance in many of these single gene mutant lines is highly dependent on the genetic background. We previously reported that a homozygous Cecr2 mutation on a BALB/c background causes exencephaly at a frequency of 74% compared with 0% on an FVB/N background. We now report that a major genetic modifier on chromosome 19, mapped using whole genome linkage analysis, increases the relative risk of exencephaly by 3.74 times in homozygous BALB embryos vs. BALB/FVB heterozygotes. Scanning electron microscopy revealed that the modifier does not affect the location of neural tube closure site 2, a known murine susceptibility factor for exencephaly. Crossing the Sp (Splotch) mutation in the Pax3 gene onto the FVB/N background for two generations indicated that this resistant strain also decreases the penetrance of spina bifida. The chromosome 19 modifier region corresponds to a linkage region on human chromosome 10q25.3 mapped in a whole genome scan of human NTD families. Since the FVB/N genetic background affects susceptibility to both exencephaly and spina bifida, the human homolog of the chromosome 19 modifier locus may be a better candidate for human NTD susceptibility factors than genes that when mutated actually cause NTDs in mice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».