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Enregistrement W2132990438 · doi:10.2174/138920006777697918

The Role of Mass Spectrometry in Biomarker Discovery and Measurement

2006· review· en· W2132990438 sur OpenAlexaff
Bradley L. Ackermann, John E. Hale, Kevin L. Duffin

Notice bibliographique

RevueCurrent Drug Metabolism · 2006
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensGreenfield Research (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMass spectrometryBiomarker discoveryProteomicsChemistryAnalyteBiomarkerDrug discoveryChromatographyElectrospray ionizationComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent advances in the biological and analytical sciences have led to unprecedented interest in the discoveryand quantitation of endogenous molecules that serve as indicators of drug safety, mechanism of action, efficacy, and dis-ease state progression. By allowing for improved decision-making, these indicators, referred to as biomarkers, can dra-matically improve the efficiency of drug discovery and development. Mass spectrometry has been a key part of biomarkerdiscovery and evaluation owing to several important attributes, which include sensitive and selective detection, multi-analyte analysis, and the ability to provide structural information. Because of these capabilities, mass spectrometry hasbeen widely deployed in search for new markers both through the analysis of large molecules (proteomics) and smallmolecules (metabonomics). In addition, mass spectrometry is increasingly being used to support quantitative measurementto assist in the evaluation and validation of biomarker leads. In this revi ew, the dual role of mass spectrometry for bio-marker discovery and measurement is explored for both large and small molecules by examining the key technologies andmethods used along the continuum from drug discovery through clinical development. Keywords: Biomarker discovery, biomarker quantitation, proteomics, metabonomics, liquid chromatography massspectrometry (LC/MS), gas chromatography mass spectrometry (GC/MS), stable isotope internal standard, matrix assisted laserdesorption ionization, electrospray ionization

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations86
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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