MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2133052195 · doi:10.1096/fj.12-203877

Novel insights into the regulation of malarial calcium‐dependent protein kinase 1

2012· article· en· W2133052195 sur OpenAlexaff
Anwar Ahmed, Kavita Gaadhe, Guru Prasad Sharma, Narendra Kumar, M. Neculai, Raymond Hui, Debasisa Mohanty, Pushkar Sharma

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthDepartment of Science and Technology, Government of KeralaNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesEuropean Commission
Mots-clésPlasmodium falciparumEffectorKinaseBiologyProtein kinase ACell biologyToxoplasma gondiiPlasmodium (life cycle)MalariaParasite hostingGeneticsImmunologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calcium-dependent protein kinases (CDPKs) are major effectors of calcium signaling in apicomplexan parasites like Toxoplasma and Plasmodium and control important processes of the parasite life cycle. Despite recently reported crystal structures of Toxoplasma gondii (Tg)CDPKs, several important questions about their regulation remain unanswered. Plasmodium falciparum (Pf)CDPK1 has emerged as a key player in the life cycle of the malaria parasite, as it may be involved in the invasion of the host cells. Molecular modeling and site-directed mutagenesis studies on PfCDPK1 suggested that several residues in the regulatory domain play a dual role, as they seem to contribute to the stabilization of both the active and inactive kinase. Mass spectrometry revealed that PfCDPK1 was autophosphorylated at several sites; some of these were placed at strategic locations and therefore were found to be critical for kinase activation. The N-terminal extension of PfCDPK1 was found to be important for PfCDPK1 activation. Unexpectedly, an ATP binding site in the NTE of PfCDPK1 was identified. Our studies highlight several novel features of PfCDPK1 regulation, which may be shared by other members of the CDPK family. These findings may also aid design of inhibitors against these important targets, which are absent from the host.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,483

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB JournalMême sujetMalaria Research and ControlTravaux en français237 207