MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2133160470 · doi:10.1139/w01-037

Diversity in the rhizobia associated with<i>Phaseolus vulgaris</i>L. in Ecuador, and comparisons with Mexican bean rhizobia

2001· article· en· W2133160470 sur OpenAlexvenueno aff
Gustavo Bernal, Peter Graham

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRhizobiaPhaseolusBiologyRhizobiumGenetic diversityBotanySymbiosisHorticultureBacteriaInoculationGeneticsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Common beans (Phaseolus vulgaris L.) have centers of origin in both Mesoamerica and Andean South America, and have been domesticated in each region for perhaps 5000 years. A third major gene pool may exist in Ecuador and Northern Peru. The diversity of the rhizobia associated with beans has also been studied, but to date with an emphasis on the Mesoamerican center of origin. In this study we compared bean rhizobia from Mexico and Andean South America using both phenotypic and phylogenetic approaches. When differences between the rhizobia of these two regions were shown, we then examined the influence of bean cultivar on the most probable number (MPN) count and biodiversity of rhizobia recovered from different soils. Three clusters of bean rhizobia were distinguished using phenotypic analysis and principal-component analysis of Box AIR-PCR banding patterns. They corresponded principally to isolates from Mexico, and the northern and southern Andean regions, with isolates from southern Ecuador exhibiting significant genetic diversity. Rhizobia from Dalea spp., which are infective and effective on beans, may have contributed to the apparent diversity of rhizobia recovered from the Mesoamerican region, while the rhizobia of wild Phaseolus aborigineus from Argentina showed only limited similarity to the other bean rhizobia tested. Use of P. vulgaris cultivars from the Mesoamerican and Andean Phaseolus gene pools as trap hosts did not significantly affect MPN counts of bean rhizobia from the soils of each region, but did influence the diversity of the rhizobia recovered. Such differences in compatibility of host and Rhizobium could be a factor in the poor reputation for nodulation and N2 fixation in this crop.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,786
Score d'incertitude au seuil0,968

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of MicrobiologyMême sujetLegume Nitrogen Fixing SymbiosisTravaux en français237 207