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Enregistrement W2133190038 · doi:10.1093/hmg/ddl039

Positive association between POU1F1 and mental retardation in young females in the Chinese Han population

2006· article· en· W2133190038 sur OpenAlexaff
Yun Sun, Fuchang Zhang, Jianjun Gao, Xiaocai Gao, Tingwei Guo, Kejin Zhang, Yongyong Shi, Zijian Zheng, Wei Tang, Yonglan Zheng, Sheng Li, Xingwang Li, Guoyin Feng, Xiaoming Shen, Lin He

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGrowth Hormone and Insulin-like Growth Factors
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHan chineseAssociation (psychology)Chinese populationGeneticsPopulationDemographySingle-nucleotide polymorphismGeneGenotypePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic defects attributable to the genes involved in the hypothalamus-pituitary-thyroid (HPT) gland axis can cause abnormal thyroid hormone function and mental retardation (MR). Pit-1, encoded by the POU1F1 gene on human chromosome 3p11, is a pituitary-specific transcription factor responsible for the expression of several pituitary hormones. Thyrotropin is one of these hormones and is an important regulator in the HPT axis. One of the symptoms of patients with POU1F1 mutations is hypothyroidism and abnormalities of the nervous system early in the period after birth. We performed a case-control association study and a quantitative analysis of IQ to investigate the possible genetic contribution of POU1F1 in the Chinese Han population. Pairwise linkage disequilibrium (LD) analysis showed that rs300996, snp-7057 and rs300977 were in strong LD. There were significant differences of allele, genotype and haplotype frequencies of these three single nucleotide polymorphisms (SNPs) between cases and controls. When we conducted a breakdown comparison between cases and controls within different gender groups, no positive results in males were found. In females, however, we found significant differences between cases and controls in allele frequency distribution of rs300996 (P=0.0003), snp-7057 (P=0.0001) and rs300977 (P=0.0005) and in the distributions of common haplotypes combined by these SNPs (global P=0.0050). The P-value was 0.0301 for rs300996 and 0.0397 for the haplotype combination of rs300996-snp-7057-rs300977 in the analysis of the quantitative effects of the alleles and haplotypes on IQ in females. Our data suggest that POU1F1 may affect MR through a gender-specific mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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