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Enregistrement W2133202786 · doi:10.1186/ar2637

The effects of infliximab therapy on the serum proteome of rheumatoid arthritis patients

2009· article· en· W2133202786 sur OpenAlexafffund
Ravi C. Dwivedi, Navjot Dhindsa, Oleg V. Krokhin, John P. Cortens, John A. Wilkins, Hani El‐Gabalawy

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRheumatoid Arthritis Research and Therapies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Arthritis Network
Mots-clésInfliximabMedicineRheumatologyRheumatoid arthritisInternal medicineEtanerceptAntirheumatic AgentsProteomeOrthopedic surgeryImmunologyTumor necrosis factor alphaBioinformaticsSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Although the clinical effects of infliximab therapy in rheumatoid arthritis have been documented extensively, the biological effects of this intervention continue to be defined. We sought to examine the impact of infliximab therapy on the serum proteome of rheumatoid arthritis patients by means of a mass spectrometry-based approach. METHODS: Sera from 10 patients with rheumatoid arthritis were obtained prior to and following 12 weeks of infliximab therapy using a standard clinical protocol. The sera were immunodepleted of the 12 highest abundance proteins, labeled by the iTRAQ (isobaric tagging for relative and absolute protein quantification) technique, and analyzed by mass spectrometry to identify proteomic changes associated with treatment. RESULTS: An average of 373 distinct proteins were identified per patient with greater than 95% confidence. In the 3 patients demonstrating the most robust clinical responses, changes of greater than 20% in the serum levels were observed in 39 proteins following treatment. The majority of these proteins were regulated directly or indirectly by tumour necrosis factor-alpha (TNF-alpha) and nuclear factor-kappa-B, with acute-phase proteins being uniformly down-regulated. A number of proteins, including members of the SERPIN family and S100A8, were down-regulated irrespective of clinical response. CONCLUSIONS: The present study demonstrates that a robust clinical response to infliximab is associated with the down-regulation of a spectrum of serum proteins regulated by TNF-alpha, and provides a possible basis for defining the broader biological effects of the treatment in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,937
Score d'incertitude au seuil0,883

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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