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Enregistrement W2133300750 · doi:10.1093/plankt/fbr041

Synechococcus growth in the ocean may depend on the lysis of heterotrophic bacteria

2011· article· en· W2133300750 sur OpenAlexafffund
Markus G. Weinbauer, Osana Bonilla-Findji, Amy M. Chan, John R. Dolan, Steven M. Short, Karel Šimek, Steven W. Wilhelm, Curtis A. Suttle

Notice bibliographique

RevueJournal of Plankton Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCentre National de la Recherche ScientifiqueGrantová Agentura České RepublikyAgence Nationale de la RechercheNational Science Foundation
Mots-clésSynechococcusBiologyBacteriaLysisSeawaterHeterotrophUltrafiltration (renal)Mediterranean seaBacterial growthDilutionCyanobacteriaMicrobiologyMediterranean climateEcologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In experiments designed primarily to investigate viral lysis, we found that the presence of viruses had a positive effect on the growth of Synechococcus. A Landry-Hassett-type stepwise dilution experiment conducted during a Synechococcus bloom in the Gulf of Mexico used both (i) 0.2-µm filtered seawater in which the abundance of bacteria and grazers were reduced but the majority of viruses were retained, and (ii) ultrafiltered (30 000 MW cutoff) virus-free seawater in which the abundance of viruses, bacteria and grazers were reduced. High growth rates and frequency of dividing cells (FDCs) were recorded in 0.2-µm filtered treatments while growth was inhibited in incubations with a high proportion of virus-free ultrafiltered water. In two subsequent experiments using Mediterranean Sea populations, a two-point dilution approach in which viral abundance was reduced by 80–90% yielded similar results, and showed that Synechococcus only grew well in the presence of viruses, bacteria and grazers. In four further Mediterranean experiments viruses removed via ultrafiltration were added back, either untreated, or inactivated by a heat treatment. Growth rates and FDCs were higher in the presence of untreated viruses than with viruses inactivated by heat, suggesting that it was not organic matter in the virus-size fraction but rather the presence of infectious viruses which sustained growth. While Synechococcus was also infected by viruses during these experiments, our data imply that growth of Synechococcus may depend upon viral lysis of heterotrophic bacteria. This finding is consistent with the view that nutrient cycling by viral lysis of heterotrophic bacteria may control phytoplankton growth and ecosystem scale carbon production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations97
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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