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Enregistrement W2133378648 · doi:10.1093/glycob/cwl085

Structure and role of sialic acids on the surface of Aspergillus fumigatus conidiospores

2007· article· en· W2133378648 sur OpenAlexaff
Mark Warwas, Jacqueline N. Watson, Andrew J. Bennet, Margo M. Moore

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAspergillus fumigatusSialic acidConidiumBiochemistryMicrobiologyChemistryNeuraminic acidLectinBiologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aspergillus fumigatus is an opportunistic fungal pathogen that causes a life-threatening invasive fungal disease (invasive aspergillosis, IA) in immunocompromised individuals. The first step of pathogenesis is thought to be the attachment of conidia to proteins in lung tissue. Previous studies in our laboratory have shown that conidia adhere to basal lamina proteins via negatively charged sugars on their surface, presumably sialic acids. Sialic acids are a family of more than 50 substituted derivatives of a nine-carbon monosaccharide, neuraminic acid. The purpose of this study was 2-fold: (1) to determine the structure of sialic acids and the glycan acceptor on A. fumigatus oligosaccharides and (2) to determine the effect on the removal of sialic acids from conidia on conidial binding to the extracellular matrix protein fibronectin and phagocytosis of conidia by cultured macrophages and type 2 pneumocytes. Surface sialic acids were removed using Micromonospora viridifaciens sialidase or using acetic acid, mild acid hydrolysis. Lectin binding studies revealed that the majority of conidial sialic acids are alpha2,6-linked to a galactose residue. High-pressure liquid chromatography of derivatized sialic acids released from conidia revealed that unsubstituted N-acetylneuraminic acid is the predominant sialic acid on the surface of conidia. Enzymatic removal of sialic acid significantly decreased the binding of conidia to fibronectin by greater than 65% when compared with sham-treated controls. In addition, removal of sialic acids decreased conidial uptake by cultured murine macrophages and Type 2 pneumocytes by 33% and 53%, respectively. Hence, sialylated molecules on A. fumigatus conidia are ligands for both professional and nonprofessional phagocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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