Phylogenetic relationships in the tribe Alysseae (Brassicaceae) based on nuclear ribosomal ITS DNA sequences
Notice bibliographique
Résumé
Sequence data from the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region of 85 species (131 accessions) were used to determine the tribal limits, monophyly status, and phylogenetic intra-tribal relationships of genera within the tribe Alysseae (Brassicaceae). Both maximum parsimony and maximum likelihood analyses support the recognition of the tribe Alysseae s. str. (12 genera: Alyssoides , Alyssum , Aurinia , Berteroa , Bornmuellera , Clastopus , Clypeola , Degenia , Fibigia , Galitzkya , Hormathophylla , and Physoptychis ). Six well-supported clades were recognized within the Alysseae clade, including two Alyssum clades (one of which includes Clypeola ), an Alyssoides and allies clade (includes Alyssoides , Bornmuellera , Clastopus , Degenia , Fibigia , Hormathophylla , and Physoptychis ), a Berteroa and allies clade (includes Aurinia , Berteroa , and Galitzkya ), a Bornmuellera clade, and a Hormathophylla clade. Morphological and cytological support for these clades is reviewed. The ITS data support the exclusion of the following taxa from the Alysseae, with appropriate tribal assignment given in parentheses: Alyssum klimesii Al-Shehbaz (Camelineae), Asperuginoides (unresolved), Athysanus (Arabideae), Botschantzevia (Arabideae), Didymophysa (unresolved), Farsetia (Malcolmieae), Lobularia (Malcolmieae), and Ptilotrichum (Arabideae). Farsetia and Lobularia are inferred to be monophyletic, and based on molecular and morphological characters they are assigned to Malcolmieae, a recently described tribe.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».