Epigenetic regulation of lymphoid specific gene sets
Notice bibliographique
Résumé
Coregulation of lymphoid-specific gene sets is achieved by a series of epigenetic mechanisms. Association with higher-order chromosomal structures (nuclear subcompartments repressing or favouring gene expression) and locus control regions affects recombination and transcription of clonotypic antigen receptors and expression of a series of other lymphoid-specific genes. Locus control regions can regulate DNA methylation patterns in their vicinity. They may induce tissue- and site-specific DNA demethylation and affect, thereby, accessibility to recombination-activating proteins, transcription factors, and enzymes involved in histone modifications. Both DNA methylation and the Polycomb group of proteins (PcG) function as alternative systems of epigenetic memory in lymphoid cells. Complexes of PcG proteins mark their target genes by covalent histone tail modifications and influence lymphoid development and rearrangement of IgH genes. Ectopic expression of protein noncoding microRNAs may affect the generation of B-lineage cells, too, by guiding effector complexes to sites of heterochromatin assembly. Coregulation of lymphoid and viral promoters is also possible. EBNA 2, a nuclear protein encoded by episomal Epstein-Barr virus genomes, binds to the cellular protein CBF1 (C promoter binding factor 1) and operates, thereby, a regulatory network to activate latent viral promoters and cellular promoters associated with CBF1 binding sites.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».