MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2133476042 · doi:10.1038/bjc.2015.231

MC1R gene variants and non-melanoma skin cancer: a pooled-analysis from the M-SKIP project

2015· article· en· W2133476042 sur OpenAlexafffund
Elena Tagliabue, Maria Concetta Fargnoli, Sara Gandini, Patrick Maisonneuve, Fan Liu, Manfred Kayser, Tamar Nijsten, Jiali Han, Rajiv Kumar, Nelleke A. Gruis, Leah M. Ferrucci, Wojciech Branicki, Terence Dwyer, Leigh Blizzard, Per Helsing, Philippe Autier, José C. García‐Borrón, Peter A. Kanetsky, Maria Teresa Landi, Julian Little, Julia Newton‐Bishop, Francesco Sera, Sara Raimondi

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquemelanin and skin pigmentation
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesBrookhaven National LaboratoryBC Cancer AgencyYale School of Public Health, Yale UniversityCancer Council NSWUniversity of California, IrvineNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteMenzies Institute for Medical ResearchAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroUniversidad de MurciaMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterUniversità degli Studi di GenovaPurdue UniversityCancer Research UKUniversity of SydneyUniversity of TasmaniaCancer Care OntarioUniversity of EdinburghINCLIVA Instituto de Investigación SanitariaUniversity of LeedsMenzies Research Institute TasmaniaUniversità degli Studi dell'AquilaUniversiteit LeidenPomorski Uniwersytet Medyczny W SzczecinieDeutsches KrebsforschungszentrumUniversity of OttawaNational and Kapodistrian University of AthensKarolinska InstitutetUniversity of MichiganUniversity of PennsylvaniaLeids Universitair Medisch CentrumMissouri Department of Health and Senior ServicesYale UniversityMoffitt Cancer CenterUniversity of North Carolina at Chapel HillBrigham and Women's HospitalState of New Jersey Department of Health
Mots-clésMelanocortin 1 receptorSkin cancerBasal cell carcinomaMelanomaOdds ratioPhenotypeCancerMedicineBasal cellGenotypePooled analysisEye colorDermatologyBiologyInternal medicineGeneticsGeneConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The melanocortin-1-receptor (MC1R) gene regulates human pigmentation and is highly polymorphic in populations of European origins. The aims of this study were to evaluate the association between MC1R variants and the risk of non-melanoma skin cancer (NMSC), and to investigate whether risk estimates differed by phenotypic characteristics. METHODS: Data on 3527 NMSC cases and 9391 controls were gathered through the M-SKIP Project, an international pooled-analysis on MC1R, skin cancer and phenotypic characteristics. We calculated summary odds ratios (SOR) with random-effect models, and performed stratified analyses. RESULTS: Subjects carrying at least one MC1R variant had an increased risk of NMSC overall, basal cell carcinoma (BCC) and squamous cell carcinoma (SCC): SOR (95%CI) were 1.48 (1.24-1.76), 1.39 (1.15-1.69) and 1.61 (1.35-1.91), respectively. All of the investigated variants showed positive associations with NMSC, with consistent significant results obtained for V60L, D84E, V92M, R151C, R160W, R163Q and D294H: SOR (95%CI) ranged from 1.42 (1.19-1.70) for V60L to 2.66 (1.06-6.65) for D84E variant. In stratified analysis, there was no consistent pattern of association between MC1R and NMSC by skin type, but we consistently observed higher SORs for subjects without red hair. CONCLUSIONS: Our pooled-analysis highlighted a role of MC1R variants in NMSC development and suggested an effect modification by red hair colour phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,485
Score d'incertitude au seuil0,951

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBritish Journal of CancerMême sujetmelanin and skin pigmentationTravaux en français237 207