Contribution of ribavirin transporter gene polymorphism to treatment response in peginterferon plus ribavirin therapy for <scp>HCV</scp> genotype 1b patients
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Standard-dose ribavirin is crucial for the standard-of-care treatment of chronic hepatitis C virus (HCV) infection. Equilibrative nucleoside transporter 1 (ENT1), encoded by SLC29A1 gene, is the main transporter that imports ribavirin into human hepatocytes. AIMS: To determine whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) at the SLC29A1 gene could influence the probability of treatment response compared with other baseline and host genetic factors. METHODS: A total of 526 East Asian patients monoinfected with HCV genotype 1b who had received pegylated interferon alpha plus ribavirin therapy were enrolled in this study. They were assigned randomly to the derivation and confirmatory groups. SNPs related to the IL28B, ITPA and SLC29A1 genes were genotyped using real-time detection polymerase chain reaction. Factors associated with sustained virological response (SVR) were analysed using multiple logistic regression analysis. RESULTS: Multivariate analysis for the derivation group identified six baseline variables significantly and independently associated with SVR: age [P = 0.023, odds ratio (OR) = 0.97], gender (P = 0.0047, OR = 2.25), platelet count (P = 0.00017, OR = 1.11), viral load (P = 0.00026, OR = 0.54), IL28B SNP rs12979860 (P = 1.09 × 10(-7) , OR = 8.68) and SLC29A1 SNP rs6932345 (P = 0.030, OR = 1.85). Using the model constructed by these independent variables, positive and negative predictive values and predictive accuracy were 73.3, 70.1 and 71.9% respectively. For the confirmatory group, they were 71.4, 84.6 and 75.3% respectively. The SLC29A1 and IL28B SNPs were also significantly associated with rapid virological response. CONCLUSIONS: The SNP at the major ribavirin transporter ENT1 gene SLC29A1 was one of significantly independent factors influencing treatment response, although the impact on the prediction was small.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».