Septin 2 phosphorylation: theoretical and mass spectrometric evidence for the existence of a single phosphorylation site <i>in vivo</i>
Notice bibliographique
Résumé
Septins constitute a family of conserved proteins that are required for cytokinesis in a wide range of organisms. Most cells express a set of septin proteins and these are found to assemble into hetero-oligomeric septin complexes that appear filamentous. However, the mechanisms controlling the function and polymerization of septins are not known. We therefore examined the possibility that septins could be post-translationally modified by phosphorylation. We present herein a combined theoretical and experimental approach for the analysis of Septin 2 (Sept2) monophosphorylation in vivo. We purified and characterized the human recombinant Sept2, a 45-kDa protein, expressed from Sf21 insect cells. Analysis by matrix-assisted laser desorption/ionization quadrupole time-of-flight mass spectrometry on the full-length protein sequence of wild-type Sept2 revealed a unique phosphorylation site at residue Ser248 in vivo, which is consistent with one of the twelve phosphorylation sites in the protein sequence theoretically predicted by the Netphos program. Additional predictions with the motif scan programs Scansite and Prosite suggest that the phosphorylation of wild-type Sept2 might be a potential substrate for casein kinase 2. Site-directed mutagenesis of residue 248 from serine to alanine abrogated this phosphorylation. The location of phosphorylation in Sept2 differs from the sites predicted for cGMP-dependent protein kinase (PKG) phosphorylation in Septin 3, raising the possibility that different septins may undergo distinct phosphorylation events that could control their functions in important cellular processes such as neurotransmission or cytokinesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».