MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2133625781 · doi:10.1002/rcm.1453

Septin 2 phosphorylation: theoretical and mass spectrometric evidence for the existence of a single phosphorylation site <i>in vivo</i>

2004· article· en· W2133625781 sur OpenAlexafffund
Yi‐Min She, Yiwei Huang, Zhang Li, William S. Trimble

Notice bibliographique

RevueRapid Communications in Mass Spectrometry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSeptinPhosphorylationCytokinesisChemistryKinaseProtein phosphorylationCell biologyBiochemistryProtein kinase ABiologyCell divisionCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Septins constitute a family of conserved proteins that are required for cytokinesis in a wide range of organisms. Most cells express a set of septin proteins and these are found to assemble into hetero-oligomeric septin complexes that appear filamentous. However, the mechanisms controlling the function and polymerization of septins are not known. We therefore examined the possibility that septins could be post-translationally modified by phosphorylation. We present herein a combined theoretical and experimental approach for the analysis of Septin 2 (Sept2) monophosphorylation in vivo. We purified and characterized the human recombinant Sept2, a 45-kDa protein, expressed from Sf21 insect cells. Analysis by matrix-assisted laser desorption/ionization quadrupole time-of-flight mass spectrometry on the full-length protein sequence of wild-type Sept2 revealed a unique phosphorylation site at residue Ser248 in vivo, which is consistent with one of the twelve phosphorylation sites in the protein sequence theoretically predicted by the Netphos program. Additional predictions with the motif scan programs Scansite and Prosite suggest that the phosphorylation of wild-type Sept2 might be a potential substrate for casein kinase 2. Site-directed mutagenesis of residue 248 from serine to alanine abrogated this phosphorylation. The location of phosphorylation in Sept2 differs from the sites predicted for cGMP-dependent protein kinase (PKG) phosphorylation in Septin 3, raising the possibility that different septins may undergo distinct phosphorylation events that could control their functions in important cellular processes such as neurotransmission or cytokinesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueRapid Communications in Mass SpectrometryMême sujetFungal and yeast genetics researchTravaux en français237 207