A <i>Legionella</i> type IV effector activates the NF-κB pathway by phosphorylating the IκB family of inhibitors
Notice bibliographique
Résumé
NF-kappaB is critical in innate immune defense responses against invading microbial pathogens. Legionella pneumophila infection of lung macrophages causes Legionnaire's disease with pneumonia symptoms. A set of NF-kappaB-controlled genes involved in inflammation and anti-apoptosis are up-regulated in macrophages upon L. pneumophila infection in a Legionella Dot/Icm type IV secretion system-dependent manner. Among approximately 100 Dot/Icm substrates screened, we identified LegK1 as the sole Legionella protein that harbors a highly potent NF-kappaB-stimulating activity. LegK1 does not affect MAPK and IFN pathways. Activation of the NF-kappaB pathway by LegK1 requires its eukaryotic-like Ser/Thr kinase activity and is independent of upstream components in the NF-kappaB pathway, including TRAFs, NIK, MEKK3, and TAK1. Cell-free reconstitution revealed that LegK1 stimulated NF-kappaB activation in the absence of IKKalpha and IKKbeta, and LegK1 efficiently phosphorylated IkappaBalpha on Ser-32 and Ser-36 both in vitro and in cells. LegK1 seems to mimic the host IKK as LegK1 also directly phosphorylated other IkappaB family of inhibitors including p100 in the noncanonical NF-kappaB pathway. Phosphorylation of p100 by LegK1 led to its maturation into p52. Thus, LegK1 is a bacterial effector that directly activates the host NF-kappaB signaling and likely plays important roles in modulating macrophage defense or inflammatory responses during L. pneumophila infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».