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Enregistrement W2133812329 · doi:10.1007/s10096-008-0661-9

Can Campylobacter coli induce Guillain-Barré syndrome?

2008· article· en· W2133812329 sur OpenAlexafffund
Alex van Belkum, Bart C. Jacobs, E. van Beek, Rogier Louwen, Wouter van Rijs, Lies Debruyne, Michel Gilbert, J. Li, A Jansz, Françis Mégraud, Hubert P. Endtz

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeripheral Neuropathies and Disorders
Établissements canadiensNational Research Council CanadaInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaUniversity of Glasgow
Mots-clésCampylobacter jejuniMicrobiologyCampylobacterBiologyAmplified fragment length polymorphismEnteritisMedical microbiologyRestriction enzymeEscherichia coliRestriction fragment length polymorphismgenomic DNAVirologyDNABacteriaPolymerase chain reactionMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campylobacter jejuni enteritis is the most frequently identified infection preceding the Guillain-Barré syndrome (GBS) and neural damage is thought to be induced through molecular mimicry between C. jejuni lipo-oligosaccharide (LOS) and human gangliosides [1].It has been questioned whether or not other Campylobacter species, including C. curvus, C. upsaliensis and C. coli, could be similarly involved [2][3][4].This is relevant because it would imply that bacterial factors considered important in the aetiology of GBS crossed species barriers.Two prior reports have appeared where C. coli was putatively associated with a case of GBS [2,3].We here present two female patients with GBS, one from the Netherlands (patient GB50) and one from France (patient 664H2004).From a faecal specimen obtained for both patients, a C. coli strain was isolated.On the basis of surface protein profiling, the strains were unequivocally demonstrated to belong to the species C. coli (results not shown).The strains were encoded GB50 and 664H2004, respectively, and stored at -80°C.For patient GB50, a serum sample obtained at the acute GBS phase was available.This sample was also stored at -80°C.Strains were grown on Mueller-Hinton agar at 37°C for 48 h, after which DNA was extracted, as described by Pitcher et al. [5].Amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis was performed, as described by Duim et al. [6].In brief, 1 µg of genomic DNA was digested with the HindIII-HhaI restriction enzyme combination and sitespecific adaptors were ligated to the restriction fragments.Primers complementary to the adaptor and restriction site sequence were used in pre-selective and selective polymerase chain reaction (PCR) amplifications.The amplified and fluorescently labelled fragments were loaded on an ABI Prism 377 automated sequencer.GeneScan version 3.1 (Applied Biosystems) was used for data collection, and the AFLP profiles were imported, using the CrvConv filter, in BioNumerics 4.61 (Applied Maths, Belgium) for normalisation and further analysis.The obtained AFLP profiles were included in an in-house AFLP reference frame, containing

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,832

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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