Identification and Characterization of Glycoproteins on the Spore Surface of Clostridium difficile
Notice bibliographique
Résumé
In this study, we identify a major spore surface protein, BclA, and provide evidence that this protein is glycosylated. Following extraction of the spore surface, solubilized proteins were separated by one-dimensional PAGE and stained with glycostain to reveal a reactive high-molecular-mass region of approximately 600 kDa. Tandem mass spectrometry analysis of in-gel digests showed this band to contain peptides corresponding to a putative exosporangial glycoprotein (BclA3) and identified a number of glycopeptides modified with multiple N-acetyl hexosamine moieties and, in some cases, capped with novel glycans. In addition, we demonstrate that the glycosyltransferase gene sgtA (gene CD3350 in strain 630 and CDR3194 in strain R20291), which is located immediately upstream of the bclA3 homolog, is involved in the glycosylation of the spore surface, and is cotranscribed with bclA3. The presence of anti-β-O-GlcNAc-reactive material was demonstrated on the surface of spores by immunofluorescence and in surface extracts by Western blotting, although each strain produced a distinct pattern of reactivity. Reactivity of the spore surface with the anti-β-O-GlcNAc antibody was abolished in the 630 and R20291 glycosyltransferase mutant strains, while complementation with a wild-type copy of the gene restored the β-O-GlcNAc reactivity. Phenotypic testing of R20291 glycosyltransferase mutant spores revealed no significant change in sensitivity to ethanol or lysozyme. However, a change in the resistance to heat of R20291 glycosyltransferase mutant spores compared to R20291 spores was observed, as was the ability to adhere to and be internalized by macrophages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».