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Enregistrement W2133890620 · doi:10.1111/j.1423-0410.2009.01277.x

The low prevalence Rh antigen Be<sup>a</sup>(Rh36) is associated with<i>RHCE*ce</i>662C&gt;G in exon 5, which is predicted to encode Rhce 221Arg

2009· article· en· W2133890620 sur OpenAlexaff
Kathryn O’Shea, Roxanne M. Gillett, Louis D. Wadsworth, Heather Hume, Janet Barnes, Jeff Kinney, Kathryn A. Hodgins, Akiko Fuchisawa, Christine Lomas‐Francis, M Reid

Notice bibliographique

RevueVox Sanguinis · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaLondon Health Sciences CentreCanadian Blood Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProbandMolecular biologyExonGeneticsLoss of heterozygosityBiologygenomic DNAComplementary DNAAntigenAlleleGeneMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVES: The low prevalence antigen, Be(a), is produced by a complex that also produces weak c, e and f (ce). We report here the molecular basis associated with Be(a) antigen expression. MATERIALS AND METHODS: Peripheral blood samples from four Be(a+) probands were tested. Haemagglutination, gDNA extraction, PCR-based assays, reticulocyte RNA isolation, Rh-cDNA analyses, and sequencing were performed by standard procedures. RESULTS: RBCs from Probands 1 and 3 were D-C-E-c+e+, and from Probands 2 and 4 were D+C+E-c+(W)e+. In proband 1, cDNA sequencing of RHCE revealed heterozygosity of nucleotide (nt) 662C/G in exon 5 of RHCE*ce. No other nucleotide changes were observed. As the 662C>G nucleotide change ablates a MscI restriction enzyme cleavage site, PCR-RFLP analysis was performed and the RHCE*ce nt 662C/G heterozygosity was detected on gDNA from the four probands and two children from both Proband 3 and Proband 4. CONCLUSION: The low prevalence Rh antigen, Be(a), is associated with a single nucleotide change in exon 5 of RHCE*ce; that of 662C>G and this change is predicted to alter proline at amino acid position 221 of Rhce to arginine. The fundamental differences in the properties of these two amino acids may impose a steric and/or charge-related effect on the protein, and thereby provide an explanation for the weakened expression of c, e and f (ce) antigens in the Be(a) phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,321
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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